shi_ra: (Default)
shi_ra ([personal profile] shi_ra) wrote2020-04-22 02:48 pm

И снова с вами рубрика эпидемиологических заметок

если они вообще кому нужны?

После того как Минздрав по ошибке отправил нескольких здоровых стариков из домов престарелых по больницам и обвинил наш институт в неправильном тестировании, мы с ними вдрызг разругались и свернули всё тестирование. Ещё в пятницу спокойненько себе работали, и в пятницу же разразился скандал. Причём ошибки у нас быть не могло, ведь все данные поступают в компьютер, и выводы делает сам Минздрав. Но видимо в Минздраве серьёзно испугались, что дело может дойти до судов и вовремя подсуетились найти козла отпущения. Так или иначе я снова совершенно общественно бесполезна. Впрочем, если за две недели никто из старичков не заболеет, ситуация может опять развернуться на 180 градусов.

Между тем у нас понемногу открывают вспомогательные отделы, выпускают народ, и скоро мы наверное вернёмся к полноценной работе. Ура!

К вопросу о тестировании. Прочла любопытную статью о попытке разобраться с тестами.
https://cmmid.github.io/topics/covid19/global_cfr_estimates.html
Нужно учитывать, что сейчас публикуется очень много неотрецензированных статей (т.е. их ещё не изучили специалисты). И эта статья тоже ещё не прошла рецензию.

Необходимо понимать, что в ситуации нехватки тестов/рабочих рук (которая существует повсеместно) тестирование в большинстве стран проводится в первую очередь с целью предоставления медицинской помощи пациентам, а не с целью создания набора данных для их изучения эпидемиологами и статистиками. Поэтому статистика в разных странах может отличаться на порядки! Невозможно высчитать статистику смертности из подобного тестирования. Например, страна, где число случаев увеличивается, потому что она проводит больше тестирований, может контролировать свою эпидемию. В стране же, где сообщается об уменьшении количества новых случаев, ситуация может ухудшиться, либо потому, что ее система слишком перегружена, чтобы проводить адекватное тестирование, либо потому, что она сокращает тестирование по каким-то своим причинам.

А значит сравнение между разными странами может быть совершенно бессмысленным. Согласно приведённой выше статье разница по выявлению новых случаев заболевания между странами, которые много и хорошо тестируют и теми, где тестирование на очень низком уровне была аж в 20 раз. Это означает, например, что в одной стране, где зарегистрировано 1000 случаев COVID-19, на самом деле может быть 5000 инфицированных, а в другой стране, которая сообщает о 1000 случаев, их может быть 100 000!
Вот согласно этой статье ситуация в Израиле очень хорошая, даже лучше чем в Норвегии, а ситуация в Америке и Англии во много-много раз хуже. Впрочем чтобы понять это достаточно посмотреть на данные по тестам в worldometers. Мы там уже на втором после Арабских Эмиратов месте по тестированию (для зануд - страны в населением в 300 тысяч-миллион я в расчёт не брала).

К вопросу о серологических тестах (на антитела - чтоб понять, сколько народу на самом деле переболело). Сейчас всё время пишут, что многие страны начинают их проводить. Учтите, что до недавнего времени не было ни одного разрешённого FDA серологического теста (на днях видела только один разрешённый). Т.е. все тесты на антитела неточные и не откалиброванные, все они могут дать много ложнотрицательных и ложноположительных результатов. Есть много других типов коронавируса, которые не такие смертельные. В исследовании в Санта-Кларе, про которое все кричат, пользовались неразрешёнными китайскими тестами. Израиль вот тоже закупил тесты двух фирм (Abbot и DiaSorin), но эти тесты ещё тоже не сертифицированы, и мы их получим только после того как они получат все разрешения.

По остальным теориям конспирации и прочим "медицинским" сенсациям, которыми чуть ли не каждый день пестрят новостные сайты. То вакцины от туберкулёза помогают от вируса, то горячая вода (хорошо, что не ослиная моча). Все врачи в мире хором утверждают, что ни разу ни за одну эпидемию гриппа не видели такого количества трупов, которые вывозят грузовиками, и что нет никакого выхода кроме как предпринимать карантинные меры чтобы снизить распространение инфекции и не обрушить полностью систему здравоохранения. С другой стороны можно, конечно, по примеру Лукашенко сделать вид, что эпидемии нет и бабы новых нарожают. Вот только общество, которое выбирает сэкономить на пожилых и больных, обречено. Ведь выжившие обычно на достигнутом не останавливаются.

Хотя на личном фронте мне очень жаль оставшихся без работы, мне не хочется чтобы повысили налоги, я хочу и в театр, и к парикмахеру, и в Грецию в июне!

[identity profile] krajuxa.livejournal.com 2020-04-24 09:31 am (UTC)(link)
В статье они берут за основу данные Кореи и раннего Уженя. А это означает что любые выкладки уже хромают на одну ногу. Что там в Ужени было думаю даже официальные китайцы не знают, а что знают до конца не скажут. Далее ложно положительные и ложно отрицательные в тех тестах которые сейчас проводятся составляют на сколько я знаю 5-10%. Это значит что ошибка диагностики ну очень велика. Поэтому собственно проверяют только тех у кого наблюдается клиническая картина. А это как известно означает что мимо радара проходят около скажем 50 % асимптотичных. Так что для оценки картины было бы правильнее следить за серологией, что бы иметь хоть какое то представление на каком мы свете.

[identity profile] shi-ra.livejournal.com 2020-04-24 04:55 pm (UTC)(link)
С одной стороны китайской статистике я не верю. С другой стороны подсчёты в статье коррелируют со статистикой на worldometers.

5-10% ошибки это немного. В ПЦР всегда могут быть ошибки, но конкретно в этом тесте делают калибровку по нескольким генам.

"Поэтому собственно проверяют только тех у кого наблюдается клиническая картина"

Думаю, всё же не поэтому, а потому что проверяют тех, кого нужно лечить. На остальных нет ресурсов.

Серология это правильно, но если нет таких тестов, исходят из того, что есть.
Edited 2020-04-24 16:55 (UTC)

[identity profile] krajuxa.livejournal.com 2020-04-24 05:20 pm (UTC)(link)
Лечить? Как лечить? Ты имеешь в виду дышать кислородом? Или закидывать всем что под руку попало в надежде что что то поможет?

[identity profile] shi-ra.livejournal.com 2020-04-24 05:29 pm (UTC)(link)
Как могут. Плазмой, ремдисивиром и т.д. А самое главное - сажать у карантин.

[identity profile] krajuxa.livejournal.com 2020-04-24 05:35 pm (UTC)(link)
Да, к сожалению это и правда самое главное. Но для этого тесты не так важны как социальное дистанцирование. Ну или тогда тесты и строгий контроль за позитивными.

[identity profile] shi-ra.livejournal.com 2020-04-24 05:43 pm (UTC)(link)
Именно. Тесты и строгий контроль. Невозможно же без конца держать страну в карантине.